Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trbv26A0A0B4J1P5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trbv26A0A0B4J1P5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv26A0A0B4J1P5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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