Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SYCP1Q15431 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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SYCP1Q15431 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
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SYCP1Q15431 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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SYCP1Q15431 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
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SYCP1Q15431 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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SYCP1Q15431 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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SYCP1Q15431 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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