Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
XRCC4Q13426 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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