Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.8 ms