Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.34
VAX2Q9UIW0 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAX2Q9UIW0 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms