Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CDKN3Q16667 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.7 ms