Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Q1T7F1 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Q1T7F1 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Q1T7F1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Q1T7F1 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Q1T7F1 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Q1T7F1 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms