Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CHD3Q12873 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CHD3Q12873 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CHD3Q12873 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CHD3Q12873 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
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CHD3Q12873 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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CHD3Q12873 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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CHD3Q12873 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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CHD3Q12873 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CHD3Q12873 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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