Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SF3B3Q15393 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SF3B3Q15393 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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