Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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PTPRDP23468 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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PTPRDP23468 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
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PTPRDP23468 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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PTPRDP23468 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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PTPRDP23468 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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