Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm4T1NXB5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms