Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt27Q9Z320 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt27Q9Z320 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms