Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt16Q9Z2K1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms