Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc23a1Q9Z2J0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms