Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms