Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms