Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ddx39bQ9Z1N5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms