Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shcbp1Q9Z179 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms