Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Apobec2Q9WV35 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms