Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scnn1bQ9WU38 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms