Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp18Q9WTV6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms