Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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