Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Wdr54Q9R0D8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms