Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lamc3Q9R0B6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms