Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtsjQ9R014 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms