Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Npas3Q9QZQ0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Npas3Q9QZQ0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Npas3Q9QZQ0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Npas3Q9QZQ0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Npas3Q9QZQ0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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