Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp21Q9QZL6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp21Q9QZL6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms