Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nufip1Q9QXX8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms