Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms