Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trpc5Q9QX29 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trpc5Q9QX29 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms