Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms