Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid2Q9QUS6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mid2Q9QUS6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms