Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk1eQ9JMK2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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