Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms