Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms