Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uchl3Q9JKB1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms