Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Msgn1Q9JK54 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms