Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cngb3Q9JJZ9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cngb3Q9JJZ9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms