Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnga3Q9JJZ8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms