Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Riox1Q9JJF3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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