Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpf2Q9JJ80 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpf2Q9JJ80 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms