Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sv2aQ9JIS5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sv2aQ9JIS5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms