Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms