Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DysfQ9ESD7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms