Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp29Q9ES63 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp29Q9ES63 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms