Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SelenofQ9ERR7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms