Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Barx1Q9ER42 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Barx1Q9ER42 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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