Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf21Q9EPU5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms