Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms