Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpv4Q9EPK8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpv4Q9EPK8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms